До недавнего времени исполнял обязанности руководителя музея Владислав Скобелев, работавший в учреждении с 1994 года. Он сменил на этом посту Андрея Минакова, ставшего фигурантом уголовного дела из-за получения взятки от студентки за положительную рецензию на дипломную работу. Минакова признали виновным по статье «Мошенничество», оштрафовали и на полтора года лишили права преподавать.