В 2017 году аудиторы выявили, что на госпредприятии было неэффективно потрачено более 35 тыс. рублей на оплату штрафов за административные правонарушения. По результатам проверки деньги вернули в кассу сотрудники, контролировавшие соблюдение законодательства в соответствующих сферах правоотношений. Ущерб предприятию был полностью возмещен.
Кроме того, вскрылся факт незаконной выплаты 68,3 тыс. рублей директору «Орелфармации» и его супруге.
Прокуратура Орловской области внесла представление в адрес учредителя предприятия — регионального департамента здравоохранения, который ненадлежаще контролировал деятельность «Орелфармации». Также в суд был направлен иск о взыскании с экс-директора предприятия и его супруги необоснованно полученных средств. Бывший руководитель возместил деньги.